这是林道尔随后35年成功工作的开端,在此期间,林道尔发现并检查了细胞内部的多种DNA修复工具。在1980年代初,因种种机缘,他来到英国工作并在英国皇家癌症研究基金会任职。1986年,他成为新设立的克莱尔霍尔实验室(Clare Hall Laboratory)主管,该实验室后来以其科学创新能力而闻名。逐渐的,林道尔开始拼接起“碱基切除修复”分子机制的图景。这一DNA修复机制中涉及糖苷酶(glycosylases),这种酶与他在1974年发现的那种酶很相似。碱基切除修复同样发生在人体内。在1996年,托马斯·林道尔成功地在试管中重现了人体内的DNA修复机制。